臨床上可提供立即性的診斷資料。

用來觀察新型隱球菌Cryptococcus neoformans的莢膜，並且可以與培養及血清學結果一起判讀有無感染。黴菌感染腦膜炎Cryptococcal meningitis使用此一檢驗，檢出率大約只有50%

關節液採自無菌區，有細菌生長即有意義。 若生長菌為下列菌種，可能是因為採檢過程消毒不完全所造成污染，需重新採 集檢體再送檢。

菌種如下：Bacillus spp.、Corynebacterium spp﹒、Propionibacterium spp﹒、coagulase–negative staphylococci、Aerococcus spp﹒、Micrococcus spp﹒。

咽喉培養主要在於診斷鏈球菌性咽炎，主要致病菌為 Group A streptococcus (Streptococcus pyogenes)。

尿路感染的定義是指外尿道與腎之間的微生物感染。從腎臟分泌出來的尿，正常情況下應是無菌的。若在尿中有微生物存在，除非所見的微生物是因尿液檢體收集、攜送或處理過程中受污染所致，或為尿道之正常菌群，否則皆屬不正常現象。

傷口培養常見的致病菌為Staphylococcus aureus、Pseudomonas aeruginosa、 Enterobacteriaceae、β-streptococcus spp.、anaerorobes。若生長菌為下列皮膚表面之常在菌，可能是因為採檢過程消毒不完全造成污染，視需要重新採集檢體再送檢。

以水中總生菌數與大腸桿菌群數來反應環境中水系統的品質。

透析單位設施、設備之管理對於病患及工作人員之安全及環境維持而言非常重要，特別是透析單位使用之儀器多與維持生命相關，其管理機制應明確並以實質之管理制度據以評估。依血液透析及腹膜透析訪視作業評量標準之水質分析定期檢測，每年度需做水質分析檢測，根據AAMI：2014標準來研判整個透析水處理系統效能是否衰退，甚至可當作更換耗材的依據。

幽門螺旋桿菌發現於慢性胃炎的病人，與胃潰瘍、十二指腸潰瘍的生理病理變化相關性證據充足，也與胃癌、胃淋巴腫瘤有關。血清檢驗幽門螺旋桿菌抗體，可以確認是否感染過，抗體陽性率超過60%。

高抗體代表最近或活動中的感染，可以使用抗生素治療，治療1-2週有效時，可以看到抗體下降，也有可能抗體轉陰性。

在正常情況下，咳痰甚少，主要是粘液，呈無色或淺白色，鏡檢可見少量的白血細胞、扁平上皮細胞和粘液。

痰液粘稠度與咳痰難易密切關係，含粘液多則粘稠，少則稀薄。觀察痰液時應除外藥物誘致粘稠度的改變。例如，服用氯化銨、化痰片、桔梗等後，可使粘痰變稀而易於咳出；給予阿托品等後致痰變稠而不利於排痰。